GFX100S使用先進的人臉和人眼檢測自動對焦演算法，即便使用大光圈拍攝景深較淺的影像，也能確保人像影像實現準確合焦。
為了達到更高的準確度，可使用人眼識別自動對焦並鎖定要優先對焦的眼睛，或是透過觸碰式螢幕與對焦搖桿，選擇、跟蹤人群中的人臉並獲得準確曝光。
搭配使用GFX100S與GF80mmF1.7 R WR鏡頭，可利用相機的相位檢測自動對焦畫素，在低至-5.5EV的光線水準下實現對焦，進而提供快速而準確的自動對焦性能。
©︎Jason Halayko
大幅改良的對焦演算法意味著GFX100S可以很容易地聚焦在移動的物體上。只需將焦點對準拍攝物件，廣角/跟蹤模式即可確保拍攝物件在畫面中移動時保持清晰。
©︎Giorgio Cravero
超越傳統光圈的功能，通過GFX100S的包圍式對焦模式獲得完整的清晰度。非常適合在光線恒定的工作室拍攝靜態物件，只需指定要對焦的最近點和最遠點，然後讓相機確定所需的幀數和階數。